Filmy lekarz, laboratorium, nadprzyrodzona moc

Kiedy wynalezione zostaje lekarstwo na mutacje, mutanci po raz pierwszy dostają możliwość wyboru: mogą zatrzymać swoje unikalne zdolności, które są jednak powodem ich izolacji i osamotnienia, albo pozbyć się ich i stać się normalnymi ludźmi. Różne punkty widzenia dwóch przywódców mutantów Charlesa Xaviera (Patrick Stewart), który domaga się tolerancji i zgody pomiędzy ludźmi i mutantami oraz Magneto (Ian McKellen), który wierzy, że przetrwać mogą tylko najsilniejsi, doprowadzają do ostatecznego testu: wojny, która ma zakończyć wszystkie wojny.

Naukowiec Sebastian Caine wbrew zakazom zwierzchników wypróbowuje na sobie substancję zapewniającą niewidzialność. Dzięki temu staje się człowiekiem bez ciała. Okazuje się jednak, że jest to efekt nieodwracalny. Caine zyskuje ogromną siłę, ale pozbywa się moralnych skrupułów. Swoich kolegów zaczyna uważać za najgorszych wrogów. Zazdrosny o swoją byłą dziewczynę, wypowiada przyjaciołom wojnę.

Profesor Charles Xavier, najpotężniejszy telepata na świecie, założył szkołę, w której "mutanci" uczą się wykorzystywać swoje moce dla dobra całej ludzkości - tej samej, która nie chce uznać ich prawa do życia i samostanowienia... W szkole profesora Xaviera pojawia się dwoje nowych "mutantów": Logan / Rosomak, samotnik ze stalowymi szponami u rąk, który posiadł niezwykłą moc regeneracji i Marie / Ruda, wyalienowana nastolatka, która pochłania siły życiowe i wspomnienia każdego, kogo dotknie. Rosomak i Ruda wstępują w szeregi "X-Menów", którzy stają do walki z dawnym kolegą profesora Xaviera, Erikiem Lehnsherrem zwanym "Magneto". Magneto, dysponujący ogromną mocą "mutant" odwrócił się od społeczeństwa, wyznaje bowiem pogląd, że ludzie i "mutanci" nie mogą pokojowo współistnieć...

Para detektywów zostaje przydzielona do wyjaśnienia szeregu spraw paranormalnych.

Po nagłej eksplozji z Instytutu Xaviera w niewyjaśniony sposób znikają telepaci: Profesor Charles Xavier oraz Jean Grey. Rok później rząd, w celu zapewnienia bezpieczeństwa ludzkości, rozpoczyna walkę z mutantami. W odpowiedzi Wolverine postanawia ponownie zebrać drużynę x-menów, która rozpadła się po zaginięciu Profesora Xaviera.

Scott Summers i Emma Frost reformują Szkołę Xaviera dla Utalentowanej Młodzieży. Stawiają sobie wyraźny cel - chcą by ich działalność zadziwiła świat. Ale gdy w mediach niespodziewanie pojawia się wstrząsająca wiadomość dotycząca leku na gen mutacji, realizacja wszystkich ich planów zostaje powstrzymana.